魚進食后，通過代謝后產生氨氮，再通過魚鰓排出體外。氨氮在轉化成為硝酸鹽過程中的中間產物就是亞硝酸鹽。氨氮——亞硝酸鹽——硝酸鹽的轉化過程是一個氧化過程，需要在高溶氧的條件下完成。所以魚池，魚缸的有效增氧不可缺少。（魚便也會排泄部分氨氮）

對于我們循環水養殖的水體來說，水中的主要危害魚類健康的物質是氨氮和亞硝酸鹽。在過濾系統尚未建立，或尚未成熟，或運轉異常時，這兩種物質的存在很讓我們煩心。

氨氮對魚的致死濃度在0.2－2.0㎎／L，小于0.2㎎／L時，會使魚類的內部器官發生病變、壞死及組織潰爛。當氨氮中的非離子氨達到0.01－0.02㎎／L時，易破壞魚鰓的粘膜層，降低血紅素攜帶氧的能力，使魚類生長緩慢。當非離子氨濃度達到0.02－0.05㎎／L時，會引發多種疾病，增加死亡；達到0.05－0.2㎎／L時，會破壞養殖魚類的皮、胃、腸道粘膜，進一步引起內部器官和體表出血；達到0.2－0.5㎎／L時，會引起魚類急性中毒死亡。

水中亞硝酸鹽含量在0 .1㎎／L時，魚體血液中的血紅蛋白變成高鐵血紅蛋白，使血液變成巧克力色，也就是養殖上常說的“褐血病”，使血紅蛋白的輸氧能力下降，鰓腫脹，攝食減少，生長緩慢，疾病增多。當濃度達到2.5㎎／L時，魚體呈中毒狀態，呼吸作用下降，體能衰弱，最后暴發疾病而死亡。

建立成熟有效的過濾系統，把氨氮和亞硝酸鹽轉化成低毒的硝酸鹽。并主要利用換水的方式，把硝酸鹽排放出去。